isolasi sel dendrit
• 2 tube untuk masing-masing sampel yang akan diuji, 1 tube untuk kontrol negative, 3 tube untuk ST1. Ditambahkan 10µl premixed IC pada setiap tube. Ditambahkan 300µl lysis buffer (hindari kontak ujung pipet dengan ujung tube). Ditambahkan 100µl sampel darah pada tube yang telah ditandai. Jangan memasukkan sampel kedalam tube kontrol.
•
Tube
ditutup dan dicampurkan selama 3-5 menit, kemudian
diinkubasi kan selama 5 menit dalam suhu 650C, sentrifugasi dengan
13000 rpm selama 30 menit suhu ruang.
•
Ditambahkan
400 µl precipitation buffer ke dalam semua tube, ditutup, dan diaduk selama 3-5
detik. Tube diputar pada
13000 rpm selama 15 menit suhu ruang. Supernatan dibuang dan dihindari kontak
antara ujung pipet tip dengan precipitate.
•
Ditambahkan
500 µl washout solution no.1 dan tabung dikocok. Tabung diputar dalam 13000 rpm
selama 5 menit suhu ruang. Supernatan dibuang
dan pellet dikeringkan 650C selama 5 menit.
•
Ditambahkan
16.5 µl elution buffer dan kocok 3-5 detik, diinkubasikan selama 10 menit dalam
650C dan diputar 13000 rpm selama 30 detik (DNA-Technology, Research
& Production, 2019).
•
RT
buffer dan RT sum diambil dan kemudian dihomogenkan dengan vortex dan
sentrifuse 1000 rpm selama 3-5 detik. Disiapkan RT mix dengan mencampur RT
buffer, RT sum dan reverse transcriptase pada tube plastic terpisah.
Ditambahkan 3.5 µl RT mix ke dalam tube dengan sample yang mengandung asam
nukleat, pipetting 5-7 kali untuk mencampurnya. Tube diletakkan dalam
thermostat dan diincubasikan dalam 400 C selama 30 menit, kemudian
950C selama 5 menit, sentrifugasi pada 13000 rpm selama 30 detik dan
cDNA (complementary DNA copy) siap digunakan untuk PCR (DNA-Technology,
Research & Production, 2019).
•
PCR
buffer dicampurkan dengan TECHNO Taq-polymerase pada suhu ruang selama 3-5 detik. Campuran
ini ditambahkan sebanyak 10µl pada tiap tube dan 20µl mineral oil juga
ditambahkan pada masing-masing tube, dilakukan vortex selama 3-5 detik ,
ditambahkan 5.0 µl sampel DNA dan tube ditutup. Tabung diputar selama 1-3
detik. Tabung diatur ke dalam Real-Time PCR Termal Cycler dan software
dijalankan (DNA-Technology, Research & Production, 2019).
Comments
Post a Comment